卢梭认为，自然教育的目的是培养"自然人"，所谓"自然人"不是原始社会的野蛮人，而是身心和谐发展的人。他体魄健康，心智发达，道德高尚，处事干练，并能从事生产劳动，自食其力的人，实际上，就是在任何情况下都能自食其力的小资产阶级上层人物。自然教育是卢梭教育理论的根本思想。其核心是教育必须顺应儿童天性发展的自然历程。即遵循儿童身心发展的特征。他曾反复强调要把儿童当作儿童去看待，"要按照你的学生的年龄特点去对待他"。

卢梭之所以强调教育必须遵循儿童的年龄特征，主要是他认为，作为人的教育三种来源之一的"自然的教育"，即人的"才能和器官的内在发展"，有其不可改变的规律性，因而"人的教育"和"事物的教育"即教育者对受教育者有意识、有目的的指导和环境对受教育者的影响，都必须遵循儿童身心发展的自然规律来进行，只有这样，儿童的开性才能得到完美的发展，成为一个真正的"自然人"。

自然教育还应尊重儿童的个性特点。卢梭认为，每个儿童的心理有他自己的形式，必须按照个别的形式进行教育。

卢梭的自然教育理论有着巨大的反封建的进步意义。他强调教育必须顺应儿童身心发展特点，大大提高了儿童在教育过程中的地位，使学生成为教育的主体，与以教师为主体，残害儿童身心的封建教育是完全对立的，开辟了现代教育理论的先河。卢梭关于教育三个来源之间关系的论述，虽存在着形而上学的观点，但已初步认识到遗传、教育、环境对人的发展的作用，对教育学理论的发展是有意义的。